不起诉为什么有案底

检察院不起诉后是否会有案底，主要取决于不起诉的具体原因：

没有违法犯罪事实

如果犯罪嫌疑人因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，则不会有案底。

犯罪情节轻微或符合特定情形

如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，而是因犯罪情节轻微或具有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一而被不起诉，则仍会有本应的案底记载。

法定不起诉

根据法定不起诉的法定事由不同，是否存在案底也不同：

不构成犯罪的，没有犯罪记录，自然也就没有案底。

法不应追究刑责的，虽然犯罪确凿无疑，但因法律规定的特殊原因才不予追究，这种也应当有犯罪记录，存在案底。

相对不起诉（构罪不诉）

相对不起诉是指检察院对侦查机关侦查终结移送审查起诉的案件，经过审查后，认为犯罪嫌疑人的犯罪行为情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚时，可以依法作出不起诉的决定。只要尚未被法院判决有罪，就不会留有案底。

存疑不起诉

存疑不起诉是指检察院对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，作出的不起诉决定。在这种情况下，嫌疑人是否犯罪是不确定的，从疑罪从无的角度来说，他是不构成犯罪的，因此没有犯罪记录，不存在案底。

综上所述，检察院不起诉后是否有案底，主要取决于不起诉的具体原因。如果犯罪嫌疑人因没有违法犯罪事实或证据不足而被决定不起诉，则不会有案底；如果因犯罪情节轻微或符合特定情形而被不起诉，则仍会有案底记载。